猪抗酶1基因核心启动子区鉴定及单倍型转录活性比较

来源：华中农业大学学报杂志2016年第3期北京时间：

作者：张爱玲

摘要：通过双荧光素酶报告基因载体系统检测猪抗酶1（AZ1）基因启动子转录活性，分析蓝塘和长白猪群体AZ1基因启动子SNP及单倍型，在此基础上比较不同单倍型转录活性。结果表明： -453/+79为核心启动子区；在2个群体中检测到AZ1基因启动子8个SNPs，分别为-713 T>C、-584 A>C、-476 G>A、-365 T>C、-348 C>T、-294 G>C、-288 T>G和 -234 T>C，蓝塘猪群体具有更丰富的单核苷酸多态性，而长白猪群体仅在-288座位存在GG和GT 2种基因型，其他7个SNPs均为纯合状态；蓝塘猪群体LTH1单倍型（TAGCCGTC，-713/-234）频率为0.526，为蓝塘猪优势单倍型，其次为LTH2（TAGCCGTT），频率为0.166；长白猪群体优势单倍型为Landrace-H（TAGTCGGT），频率为0.939。LTH1转录活性高于LTH2和Landrace-H，推测-234 T>C、-365 T>C和-288 T>G座位是造成不同单倍型转录活性差异的原因。

关键词：猪; 抗酶（AZ1）基因; 启动子; SNP; 单倍型

基金资助：国家自然科学基金项目（31201771）; 现代农业产业技术体系专项(CARS-36)