尖孢镰刀菌甜瓜专化型基因组规模分泌蛋白的预测与分析

来源：华中农业大学学报杂志2016年第3期北京时间：

作者：聂燕芳

摘要：利用SignalP、WoLF PSORT、TMHMM、big-PI Predictor、TargetP和SecretomeP等软件，对尖孢镰刀菌甜瓜专化型（Fusarium oxysporum f. sp. melonis，FOM）全基因组26 811条蛋白质氨基酸序列进行了分泌蛋白的预测分析。结果表明，FOM全基因组编码蛋白中有1 145个经典分泌蛋白，占编码蛋白总数的4.3%；有8 471个非经典分泌蛋白，占编码蛋白总数的31.6%。对经典分泌蛋白特征进行分析，发现其氨基酸长度集中在100~600个氨基酸，信号肽长度集中在17~22个氨基酸。对经典分泌蛋白的功能预测分析表明，有605个分泌蛋白获得了注释，主要涉及糖代谢、转运过程、过氧化氢代谢和生物合成等。对碳水化合物酶类(CAZymes)进行分析，结果表明有277个分泌蛋白为CAZymes，占经典分泌蛋白总数的24.2%。

关键词：尖孢镰刀菌甜瓜专化型; 分泌蛋白; 信号肽; 碳水化合物酶类; 蛋白功能预测

基金资助：国家自然科学基金项目（30971887）； 广东省普通高校青年创新人才项目(粤教科函［2015］3号) 