黄单胞菌Xanthomonas campestris pv. Raphani 756C中Ⅵ型分泌蛋白的生物信息学分析
来源：华中农业大学学报杂志2016年第4期北京时间：
作者：韩长志
摘要：为明确黄单胞菌Xanthomonas campestris pv. raphani 756C（Xcr）中存在的Ⅵ型分泌蛋白（Tss）数量及其所具有的信号肽、保守motif等信息以及该菌中Tss与其他病菌中同源序列之间的遗传关系，利用关键词对Xcr蛋白质数据库进行搜索，并对Xcr中Tss氨基酸序列开展信号肽、跨膜结构域以及保守基序（motif）的生物信息学分析，同时，对Xcr中所含有的Tss与其他病原菌中同源序列之间的遗传关系进行分析。明确Xcr中存在3个Tss，分别命名为TssA、TssB、TssC，上述Tss均含有高于50%比例的??螺旋结构，均定位在细胞膜上以及具有3个保守motif，而就信号肽而言，仅TssC含有明显的信号肽序列。Xcr中的Tss与Xcc、Xca等黄单胞菌属病菌中的Tss具有较近的亲缘关系。
关键词：Xanthomonas campestris pv. raphani 756C; Ⅵ型分泌系统; Ⅵ型分泌蛋白; 黄单胞菌属
基金资助：云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特植物保护与繁育重点实验室开放基金项目（201605）； 国家自然科学基金项目（31200488，31560211）；云南省科技计划项目（2015IA005）；云南省森林灾害预警与控制重点实验室开放基金项目（ZK150004）；云南省教育厅科学研究基金项目（2014Y330）
