蓝细菌16S rRNA双甲基化酶基因ksgA的进化分析、蛋白结构预测及功能验证

来源：华中农业大学学报杂志2016年第6期北京时间：

作者：王婧蓝

摘要：为研究核糖体小亚基rRNA双甲基化酶基因ksgA的进化关系、蛋白结构和功能，利用MEGA 5.2软件构建了37种蓝细菌ksgA基因和16S rDNA的系统进化树，通过SWISS-MODEL分析和预测KsgA的蛋白质结构模型，并通过克隆集胞蓝细菌Synechocystis sp. strain PCC 6803、鱼腥蓝细菌Anabaena sp. strain PCC 7120和聚球蓝细菌Synechococcus elongates sp. strain PCC 7942 的ksgA基因对大肠杆菌ksgA突变体进行了异源互补。结果表明：ksgA基因在蓝细菌中与16S rDNA进化分支高度相似，且体现出蓝细菌进化的聚类特征；蓝细菌KsgA甲基化酶与该蛋白家族的其他蛋白质拥有共同的保守结构、催化位点和配体结合位点；克隆的3种蓝细菌ksgA基因均能在一定程度上互补大肠杆菌ksgA基因的功能。

关键词：ksgA; 蓝细菌; 双甲基化修饰; 序列分析; 蛋白结构预测; SWISS-MODEL

基金资助：国家自然科学基金项目（31570048）； 中央高校基本科研业务费专项（2014PY003）