细胞自噬相关基因在水稻纹枯病菌菌核发育过程中的定量分析

来源：华中农业大学学报杂志2018年第2期北京时间：

作者：舒灿伟

摘要：在前期研究中，采用RNA-seq技术获得了在水稻纹枯病菌菌核发育过程中差异表达的6个自噬相关基因，为阐明这些基因在水稻纹枯病菌菌核发育过程中的表达模式，提取了菌核发育过程中3个阶段的RNA，根据特异基因的序列设计引物，采用实时荧光定量PCR技术分析这些基因的表达谱。结果表明，丝氨酸/苏氨酸激酶和ssp1、ATG13和Vam6基因的表达量在白色菌核形成阶段的表达量显著升高，而在菌核发育成熟阶段的表达量明显下降。而丝氨酸/苏氨酸-蛋白磷酸酶基因和丝氨酸/苏氨酸激酶受体相关蛋白基因的表达量在菌核发育阶段呈现出连续下降的趋势。研究发现这6个与细胞自噬有关的基因的表达谱与转录组测序的结果一致，表明转录组测序的结果可靠；同时也表明了这些基因高度响应了菌核的发育过程。

关键词：水稻纹枯病菌; 自噬相关基因; 实时荧光定量PCR; 基因差异表达

基金资助：广东省自然科学基金（博士启动）项目（2016A030310454）; 国家自然科学基金项目（31271994）