团头鲂低氧耐受相关SNPs标记的开发

来源：华中农业大学学报杂志2019年第2期北京时间：

作者：陈柏湘

摘要：为寻找耐低氧相关SNPs分子标记辅助团头鲂优良品种选育，利用团头鲂低氧耐受和敏感群体的转录组数据，进行SNPs位点的开发和鉴定，获得52 623个可能的SNPs位点，其中碱基转换和颠换型位点分别占57.4%（30 192个）和31.9%（16 802个）；同义SNPs占编码区总SNPs的99.7%，非同义SNPs仅有32～35个；使用PCRRFLP技术对筛选出的5个非同义的多态性SNPs进行耐低氧性状关联分析。结果显示，Plin2A1157G和Hif3αA2917G位点的SNPs在团头鲂亲本群体中与低氧耐受性状显著相关，但在子代群体中却与低氧耐受性状无显著相关性。这说明亲代中筛选出的分子标记并不一定适用于子代群体，在利用分子标记辅助育种时需要考虑标记在子代中的有效性。

关键词：团头鲂; 低氧; SNP; 性状关联分析

基金资助：国家自然科学基金项目（31872542）；中央高校基本业务费专项（2013PY067）