《化学通报杂志》发表论文赏析

趋化因子CCR2的同源模建,分子对接和3D-QSAR研究

来源:化学通报杂志2016年第9期北京时间:

作者:刘蒙蒙,丁雪垒,周朋朋,舒茂,林治华

摘要:CCR2参与炎症反应、免疫移植排斥和肿瘤的发生,已成为新的研究热点。本文以CCR5的晶体结构为模板,同源模建CCR2的结构,并用CCR2小分子抑制剂与其进行分子对接以得到小分子的最优构象。在对接叠合的基础上建立了QSAR模型,采用比较分子场分析(CoMFA)以及比较分子相似性分析(CoMSIA)研究得到CoMFA和CoMSIA模型最佳评价参数分别为q2=0.743,r2=0.968和q2=0.68,r2=0.978。通过分析3D-QSAR模型的等势图得出改造配体R3基团可提高化合物活性。所建模型稳定性好、预测性强,对CCR2相关疾病药物的设计、优化和改造提供了参考。

关键词:CCR2 同源模建 分子对接 3D-QSAR,

基金资助:国家自然科学基金项目(81171508); 重庆市自然科学基金重点项目(CSTC 2013 JJB10004);重庆市教委科技项目(KJ1500943,KJ1400946)

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