《环境与职业医学杂志》发表论文赏析
作者:王召杰, 马熙骁, 刘贤侠, 陈阳贵, 向雪滢, 胥婉婷, 金纪国, 武凡, 卫香楠, 吴建勇, 李富业,
摘要:背景动物养殖因素可影响从业人员肠道菌群结构及其多样性,但国内目前缺乏奶牛养殖作业对从业人员肠道菌群影响的研究。目的分析奶牛养殖从业人员、奶牛和对照人群(非动物接触职业人群)肠道菌群多样性特征,评估奶牛养殖对从业人员肠道菌群的影响。方法采用16S rRNA全长扩增子测序技术,对60份奶牛场从业人员、89份奶牛及50份一般人群粪便样本进行测序,并分析操作分类单元(OTUs)、alpha多样性、beta多样性及门、科、属水平物种组成等肠道菌群结构特征。比较3组样本之间的肠道菌群差异,探讨职业暴露对奶牛养殖从业人员肠道菌群结构的影响。结果在从业人员、奶牛和一般人群肠道菌群中共计发现50478 OTUs,分别含有23613、42723 和16592个OTUs。奶牛与一般人群肠道菌群共同OTUs数为12674(27.17%);一般人群与从业人员肠道菌群之间共同OTUs数为10099(33.54%);奶牛与从业人员肠道菌群共同OTUs数为17690(36.36%)。相比于一般人群,从业人员与奶牛肠道菌群拥有更多的共同菌群(P<0.01)。同时,从业人员的肠道厚壁菌门(Firmicutes)丰度高于一般人群(P<0.01),而放线菌门(Actinobacteriota)和变形菌门(Proteobacteria)则与之相反(P<0.01)。从业人员肠道菌群alpha多样性与一般人群存在差异:从业人员ACE指数略低于一般人群,远低于奶牛(P<0.05);而Shannon指数高于一般人群,但低于奶牛(P<0.01)。线性判别分析(LEfSe)发现从业人员肠道菌群中厚壁菌门毛螺菌科(Lachnospiraceae)和瘤胃球菌科(Ruminococcaceae)丰度明显高于一般人群,链球菌科(Streptococcaceae)、乳杆菌科(Lactobacillaceae)、双歧杆菌科(Bifidobacteriaceae)、肠杆菌科(Enterobacteriaceae)、红斑丹毒丝菌科(Erysipelatoclostridiaceae)丰度低于一般人群。结论奶牛养殖从业人员肠道菌群与奶牛之间拥有一定比例的共同菌群,奶牛养殖作业会影响从业人员肠道菌群结构和多样性,增加毛螺菌科和瘤胃球菌科的丰度,但减少链球菌科、乳杆菌科、双歧杆菌科、肠杆菌科、红斑丹毒丝菌科的丰度。研究结果为进一步探讨奶牛饲养职业暴露相关病原体的跨宿主传播提供参考数据。
关键词:职业暴露, 奶牛养殖, 16S rRNA, 肠道菌群, 菌群结构, 菌群多样性,