上海市贝类水产品诺如病毒污染状况及基因分型

来源：环境与职业医学杂志 2021年第8期北京时间：

作者：吴立梦, 滕峥, 崔晓青, 王葳, 狄弘玮, 匡小舟, 任宏, 刘弘, 袁政安, 张曦, 林庆能,

摘要：背景诺如病毒（NoV）是影响食品卫生与安全的重要污染物。贝类可富集环境水体中的病毒，是重要的食源性病原体传播载体。目的了解NoV在上海市贝类水产品中的污染状况，并对阳性株进行鉴定分型，为预防食源性疾病的发生，制定防控措施提供参考依据。方法采用实时荧光逆转录聚合酶链式反应法对2017—2019年上海地区采集的580份贝类水产品中NoV进行检测，用逆转录巢式聚合酶链式反应法对部分阳性样本病毒衣壳蛋白（VP）1区扩增片段进行分型分析。结果580份贝类样品中NoV检出率为8.97%，其中NoV GⅠ型检出率为2.24%（13/580），NoV GⅡ型检出率为5.86%（34/580），NoV GⅠ和GⅡ混合型检出率为0.86%（5/580）。四个季节的贝类水产品中NoV检出率的差异有统计学意义（χ2=8.132，P=0.043），冬春季较高；不同种类贝类水产品NoV检出率差异有统计学意义（χ2=14.152，P=0.049），以蚌科、牡蛎科为高。VP1区部分核酸序列分子系统进化分析显示，贝类水产品中可检测到NoV GⅡ.2、3c、13、17共4个NoV GⅡ型的基因亚型存在。1株GⅡ.2型与参考株X81879同源性为88.8%；2株GⅡ.3c型之间同源性为91.6%，与参考株AB385626同源性为87.1%~92.0%；1株GⅡ.13型与参考株AY113106同源性为93.6%；1株GⅡ.17型与参考株LC037415同源性为98.6%，与2014年发现的江苏南京株KU757049和上海株KT380915同源性分别为97.8%和97.4%。结论上海地区贝类水产品中存在NoV污染，且污染具有季节特点，以冬春季污染较严重；其基因型以GⅡ型为主。

关键词：贝类水产品, 诺如病毒, 基因分型,