海洋沉积物中硫酸盐还原菌和硫氧化菌群落分析方法的比较

来源：环境科学杂志2018年第1期北京时间：

作者：张玉,米铁柱,甄毓,陈烨,付璐璐,王勋功

单位：中国海洋大学环境科学与工程学院, 青岛 266100,海洋环境与生态教育部重点实验室, 青岛 266100,青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室, 青岛 266071,中国海洋大学环境科学与工程学院, 青岛 266100,海洋环境与生态教育部重点实验室, 青岛 266100,青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室, 青岛 266071,中国海洋大学环境科学与工程学院, 青岛 266100,海洋环境与生态教育部重点实验室, 青岛 266100,青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室, 青岛 266071,海洋环境与生态教育部重点实验室, 青岛 266100,青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室, 青岛 266071,中国海洋大学海洋生命学院, 青岛 266003,海洋环境与生态教育部重点实验室, 青岛 266100,青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室, 青岛 266071,中国海洋大学海洋生命学院, 青岛 266003,中国海洋大学环境科学与工程学院, 青岛 266100,海洋环境与生态教育部重点实验室, 青岛 266100,青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室, 青岛 266071

摘要：硫酸盐还原菌（sulfate-reducing prokaryotes，SRP）和硫氧化菌（sulfur-oxidizing prokaryotes，SOP）在硫的生物地球化学循环中发挥着极为重要的作用.本文以SRP作为高丰富度高多样性菌群代表，针对于SRP所共有的异化型亚硫酸盐还原酶（dissimilatory sulphite reductase，DSR）中的β亚基基因（dsrB），通过克隆文库技术、454高通量测序技术和Illumina高通量测序技术对其群落特征进行比较分析.结果表明，Illumina高通量测序技术优于454高通量测序技术和克隆文库技术，特别在低丰度物种的检测方面，Illumina高通量测序技术具有明显优势.以SOP soxB基因（~750 bp）作为较长基因片段的代表，分别采用454高通量测序技术和Illumina单端高通量测序技术对SOP群落组成和多样性信息进行比较分析，结果表明，454高通量测序技术在读长上的优势并未体现出来，而Illumina单端高通量测序技术优于454高通量测序技术.

关键词：硫酸盐还原菌,硫氧化菌,高通量测序,克隆文库,沉积物,