基于16S rRNA测序技术的青藏高原河流细菌群落多样性

来源：环境科学杂志2023年第1期北京时间：

作者：璩伟卿,张博美,黄雪,任泽,高红凯

单位：华东师范大学地理科学学院, 上海 200241,华东师范大学地理科学学院, 上海 200241,华东师范大学地理科学学院, 上海 200241,北京师范大学自然科学高等研究院, 珠海 519087,华东师范大学地理科学学院, 上海 200241,华东师范大学地理信息科学教育部重点实验室, 上海 200241

摘要：近年来由于气候变化和人类活动等影响,我国青藏高原生态系统面临退化风险.微生物作为河流生态系统的重要组成部分,能够反映流域的总体变化,是生态系统健康程度的指示器.为调查青藏高原河流生态系统的细菌群落多样性和组成特点,于2021年7月在青藏高原地区的黄河、长江、澜沧江、怒江、雅鲁藏布江和柴达木盆地流域进行大范围水样采集,共收集样品65个,并基于16S rRNA技术对样品中细菌进行测序分析.结果表明,共检测出的细菌群落涵盖65门1311属,各流域α多样性指数较高,说明青藏高原河流细菌的丰富度和多样性均处于较高水平.其中,表征物种丰富度的Chao指数和OTU richness指数均与SRP/TP的值有极显著负相关关系.门水平优势类群主要有变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidota)、放线菌门(Actinobacteriota)和蓝细菌门(Cyanobacteria);纲水平优势类群主要有γ-变形菌纲、拟杆菌纲和α-变形菌纲;属水平优势群主要有Flavobacterium和Limnohabitans.通过主坐标分析(PCoA)和置换多因素方差分析(Adonis)表明,细菌群落组成在青藏高原各流域间有极显著差异.典范对应分析(CCA)说明:电导率、pH、流域平均归一化植被指数、溶解性硅、溶解性有机碳、流域平均坡度、河网长度、流域面积、灌木面积占比和流域平均海拔对细菌群落产生显著影响.其中,电导率是青藏高原河流细菌群落分布的最大影响因素.该结果为认识青藏高原流域细菌群落的组成,识别影响细菌群落多样性的环境因子提供了基础资料.

关键词：16S rRNA|青藏高原(QTP)|河流|微生物多样性|流域,