昌黎县海域细菌群落和抗生素抗性基因分析

来源：环境科学杂志2024年第1期北京时间：

作者：王秋水,程波,刘悦,邓婕,徐岩,孙朝徽,袁立艳,左嘉,司飞,高丽娟

单位：北京市科学技术研究院分析测试研究所(北京市理化分析测试中心), 北京 100089,中国水产科学研究院, 农业农村部水产品质量安全控制重点实验室, 北京 100141,北京市科学技术研究院分析测试研究所(北京市理化分析测试中心), 北京 100089,北京市科学技术研究院分析测试研究所(北京市理化分析测试中心), 北京 100089,中国水产科学研究院北戴河中心试验站, 秦皇岛 066100,中国水产科学研究院北戴河中心试验站, 秦皇岛 066100,北京市科学技术研究院分析测试研究所(北京市理化分析测试中心), 北京 100089,北京市科学技术研究院分析测试研究所(北京市理化分析测试中心), 北京 100089,中国水产科学研究院北戴河中心试验站, 秦皇岛 066100,北京市科学技术研究院分析测试研究所(北京市理化分析测试中心), 北京 100089

摘要：为了解秦皇岛昌黎县水产养殖海域微生物分布情况及各种抗性基因的污染状况,使用高通量测序技术,采用16S rDNA基因测序和宏基因组测序方法对春季养殖海域中的海水、底泥及土著鱼类矛尾复鰕虎鱼肠道内容物进行研究.结果表明,海水中以变形菌门（Proteobacteria）、厚壁菌门（Firmicutes）和拟杆菌门（Bacteroidota）为主要优势菌门；底泥中以变形菌门（Proteobacteria）、泉古菌门（Crenarchaeota）、酸杆菌门（Acidobacteriota）和放线菌门（Actinobacteriota）为主；鰕虎鱼肠道内容物以变形菌门（Proteobacteria）、蓝藻细菌（Cyanobacteria）、厚壁菌门（Firmicutes）和拟杆菌门（Bacteroidota）为主.底泥样本中的微生物多样性最丰富,其次是海水样本,鱼类肠道内容物的微生物多样性最低.且不同位点的同类样本之间微生物多样性较为相似,同一位点的不同类样本中的微生物多样性差别较大.对于不同位点的样本,各位点海水样本之间微生物群落结构均存在显著差异,各位点底泥样本之间差异较小,且有些底泥样本组间不存在显著的微生物组成差异.在所有样本组中,检测到的抗性基因主要为：β-内酰胺类抗生素抗性基因有5个（bla_OXA-325、cepS、bla_CARB-20、bla_OXA-55和bla_TRU-1）,氨基糖苷类抗生素抗性基因有4个[aac（6'）-IIb、amrA、aac（6'）-Ie-aph（2″）-Ia和aph（3'）-Vc].抗生素抗性基因与微生物群落之间也存在一定的相关性.

关键词：昌黎县,海水养殖,海水,底泥,肠道内容物,微生物多样性,抗生素抗性基因（ARGs）,