规模化畜禽养殖粪便中接合型耐药质粒污染及耐药基因赋存特征

来源：环境科学杂志2025年第1期北京时间：

作者：李莹,申磊,高浩泽,郭雅杰,王旭明,赵国柱,仇天雷

单位：北京林业大学生物科学与技术学院, 北京 100083,北京市农林科学院生物技术研究所, 北京 100097,廊坊师范学院生命科学学院, 廊坊 065000,北京林业大学生物科学与技术学院, 北京 100083,北京市农林科学院生物技术研究所, 北京 100097,北京市农林科学院生物技术研究所, 北京 100097,北京林业大学生物科学与技术学院, 北京 100083,北京市农林科学院生物技术研究所, 北京 100097

摘要：近年来,细菌病原体中抗生素耐药性的出现和传播对公众健康构成严重的威胁. 为了解规模化养殖畜禽粪便中质粒介导的可移动抗生素耐药基因（ARGs）的赋存情况和转移特征,对北京、河北和宁夏等地区的蛋鸡、肉鸡和生猪规模化养殖场粪便进行耐药接合型质粒（CARP）的捕获与分析. 采用滤膜接合法对养殖场畜禽粪便中的CARP进行捕获并计算转移频率和流行率. 通过接合子基因组二代测序获得质粒携带ARGs信息,比对PlasimidFinder 数据库鉴定耐药质粒的复制子类型. 利用药敏纸片扩散法（Kirby-Bauer法）对接合子进行耐药表型测定. 结果表明,35个规模化养殖场捕获了125个CARP,共携带13类65种ARGs,最常见的ARGs为floR、aac（6′）-lb7和TEM-150. 不同养殖动物粪便中CARP流行情况有一定差异,其中蛋鸡粪中CARP具有更高的转移能力和流行率,但其多重耐药程度要弱于肉鸡和猪粪. 共检出49种共有的ARGs,其中64%属于氨基糖苷类、 β-内酰胺类、氟喹诺酮类和甲氧苄啶类. 64株典型接合子的耐药表型也有类似特点,主要对β-内酰胺类（95.31%）、四环素类（89.06%）、氨基糖苷类（87.5%）和氟喹诺酮类（68.75%）抗生素耐药率较高. 猪粪中检出IncH型、IncN型和IncR型这3种广宿主范围质粒,猪场中12.5% 接合子携带5个及以上高风险ARGs,比例高于其他养殖场. 研究表明,畜禽粪便中CARP普遍携带多种类型的ARGs,使宿主菌具有多种抗生素耐药能力；高风险ARGs被广宿主范围接合型质粒所携带,增加了其由养殖场向周边环境传播的风险.

关键词：畜禽养殖,接合型质粒,抗生素耐药基因（ARGs）,表型,复制子,