《环境昆虫学报杂志》发表论文赏析
作者:齐晓阳,任小云,安涛,陈红印,黄建,张礼生*
单位:(1 福建农林大学植物保护学院 农业部闽台作物有害生物综合治理重点实验室,2 中国农业科学院植物保护研究所 中美生物防治实验室
摘要:对七星瓢虫正常发育、滞育以及滞育解除的雌成虫进行RNA测序,并对筛选出来的滞育相关基因进行KEGG通路富集分析,从分子水平解析七星瓢虫滞育发机理。本研究以正常发育产卵、滞育30 d以及滞育贮存30 d 后解除产卵的七星瓢虫雌成虫为研究对象,分别抽提RNA,合成cDNA,构建cDNA文库,文库检测合格后在Illummina Hiseq 2500测序仪上进行双向测序。根据测序结果,共获取unigene 82820个。采用两两比较法对正常发育组和滞育组、滞育组和滞育解除组进行差异表达分析,分别获得差异表达基因3501个和1427个。深入分析两组比对结果,将在滞育组上调且滞育解除组下调的unigene定义为滞育关联基因,共有443个基因为滞育关联基因。应用KEGG KAAS在线pathway比对分析工具对滞育关联基因进行通路富集分析,结果发现这些基因主要集中在碳水化合物代谢、脂质代谢以及信号转导等途径中。
关键词:七星瓢虫,滞育,转录组测序,滞育关联基因,KEGG分析、碳水化合物代谢,
基金资助:国家自然科学基金(31572062) ; 国家重点基础研究发展计划(973)项目 (2013CB127602) ; 公益性行业 (农业) 科研专项 (201103002)