《环境昆虫学报杂志》发表论文赏析

访花昆虫野蚜蝇线粒体基因组结构分析

来源:环境昆虫学报杂志2021年第4期北京时间:

作者:闫 艳,程梦迪,曹春桥,李 虎

单位:陕西理工大学生物科学与工程学院

摘要:野蚜蝇 Syrphus torvus ( Osten-Sacken) 成虫具访花习性,是重要的传粉昆虫; 幼虫捕食蚜虫,是蚜虫重要天敌之一。本研究通过高通量测序、组装拼接获得了完整的野蚜蝇线粒体基因组全序列 ( GenBank 登录号: MW074962) ,其序列全长为 16 444 bp,包含 13 个蛋白编码基因 ( PCGs)、22 个 tRNAs、2 个 rRNAs 和 D-loop 区。 野蚜蝇线粒体全序列 A + T 含量为 80.6% ,G + C 含量为 19.4% ,表现出明显的 A + T 偏斜。除了 COXI、ATP8、ATP6 和 ND1 的起始密码子为 TTG,其它 9 个 PCGs 以 ATN 为起始密码子; COXI 的终止密码子为不完整的 T - -, ATP6 为 TAG,其余 11 个 PCGs 的终止子为 TAA。22 个 tRNAs 的二级结构均为典型的三叶草结构,并预测了野蚜 蝇 rRNAs 的二级结构。野蚜蝇 D-loop 区存在重复序列和茎环结构,22 种蚜蝇科基因间隔区与重叠区具有 6 个保守区域。基于 24 个物种 ( 22 个蚜蝇科和 2 个缟蝇科) 的 PCGs 序列,通过贝叶斯法 ( BI) 和最大似然法 ( ML) 构 建系统发育树,结果显示,野蚜蝇和黑足蚜蝇 Syrphus vitripennis 互为姊妹种,支持了蚜蝇亚科 Syrphinae 的单系性,两种拓扑结构中管蚜蝇亚科 Eristalinae 均没有聚为一支。该研究结果丰富了蚜蝇科线粒体基因组学基本数据,为进一步深化蚜蝇科系统发育关系讨论提供了参考。

关键词:蚜蝇,线粒体基因组,系统发育,

基金资助:陕西省科技厅自然科学基础研究计划 (2020JQ-869); 陕西理工大学开放课题研究基金 (SLGPT2019KF03-01); 陕西理工大学研究生创新基金项目 ( SLGYCX2015); 中国博士后科学基金 (2016M590968)

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