《环境昆虫学报杂志》发表论文赏析
作者:寇桂香,陈帅,来有鹏,何啟月,牛烁,周渊涛
单位:1. 青海大学农牧学院,2. 青海省农林科学院植物保护研究所
摘要:本研究基于转录组学对梨星毛虫Illiberis pruni不同生长发育阶段的差异表达基因(DEGs)进行筛选和功能注释分析,揭示与梨星毛虫生长发育相关的关键基因和信号通路。采用高通量测序技术Illumina HiSeqTM 2000检测梨星毛虫幼虫、蛹、成虫转录组差异,并对测序后筛选出的差异表达基因进行实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证。结果表明,转录组数据共获得80 528条Unigene,其中长度在1 kb以上的Unigene有21 743条,25 643条Unigene从七大数据库中得到注释,筛选出12个梨星毛虫不同生长发育阶段的差异表达基因,且RNA-Seq测序结果与RT-qPCR验证结果一致。研究结果将扩充梨星毛虫生长发育基因数据库信息,进一步为其在分子水平上的研究提供数据支撑。
关键词:梨星毛虫,转录组,生长发育,差异表达基因,
基金资助:(千人计划)昆仑英才?乡村振兴人才农业农村科技攻关团队(k9923138)