《环境昆虫学报杂志》发表论文赏析

茶银尺蠖触角转录组及相关嗅觉基因的分析

来源:环境昆虫学报杂志2025年第2期北京时间:

作者:张方梅,尤伟晨,郭世保,陈俊华,史洪中,耿书宝,周 洲,乔 利

单位:信阳农林学院

摘要:本研究利用IIIumina Hiseq 4000高通量测序平台对茶银尺蠖Scopula subpunctaria(Herrich-Schaeffer)雌雄成虫触角进行转录组测序,共获得93 335条unigenes,N50长度为1 151 bp。通过基因功能注释,有23 581条unigenes注释到六大公共数据库中,其中注释到NR数据库的unigenes最多,占39.96%,且与家蚕Bombyx mori相似基因数目最多,占20.32%;10 718条unigenes注释到GO数据库的生物过程、细胞组分和分子功能3个大类46个亚类;5 464条unigenes注释到KEGG数据库的38个小类代谢通路,其中注释在信号传导通路的unigenes最多,占10.64%。根据注释信息,共筛选得到60个候选嗅觉基因,包含17个气味结合蛋白基因(Odorant binding protein genes,OBPs)、13个化学感受蛋白基因(Chemosensory protein genes,CSPs)、14个嗅觉受体基因(Olfactory receptor genes,ORs)、13个离子型受体基因(Ionotropic receptor genes,IRs)和3个感觉神经膜蛋白基因(Sensory neuron membrane protein genes,SNMPs)。利用FPKM值对SsubOBPs和SsubCSPs基因进行表达量分析发现,SsubOBP2和SsubOBP3在茶银尺蠖雌雄成虫触角中均高丰度表达(FPKM>2 000),SsubCSP4、SsubCSP7和SsubCSP9在茶银尺蠖雌雄成虫触角中均高丰度表达(FPKM>900)。本研究首次获得了茶银尺蠖触角转录组数据,并鉴定出候选嗅觉相关基因,结果为进一步研究茶银尺蠖的嗅觉感受机制提供分子基础。

关键词:茶银尺蠖,触角转录组,嗅觉相关蛋白,基因注释,

基金资助:河南省大别山实验室重点课题(DMLP006);河南省中央引导地方科技发展资金项目(Z20221341063);信阳农林学院创新团队建设项目(XNKJTD-007,KJCXTD-202001);河南省高等学校重点科研项目(24B210012),信阳生态研究院开放基金(2023XYQN08,2023XYMS11);河南省国际科技合作项目(242102520042);河南省科技攻关项目(242102110178)

填文献完整题目 获取完整文献

填写需求
联系方式
注:学术顾问会在1小时内联系您,请留意!