中华蜜蜂肠道菌Gilliamella sp. G0441分离、鉴定及基因组分析

来源：环境昆虫学报杂志2025年第2期北京时间：

作者：彭烨华，高 杨，张立富，黄少康，李文峰

单位：1. 福建农林大学动物科学学院（蜂学学院）,2. 广东省科学院动物研究所 广东省动物保护与资源利用重点实验室,3. 华南农业大学植物保护学院

摘要：蜜蜂肠道菌群由一组特定的细菌组成，在宿主营养代谢、免疫调节及解毒等方面发挥重要作用。本研究对一来自中华蜜蜂Apis cerana cerana工蜂肠道的菌株——G0441进行了分离、鉴定以及基因组分析。G0441菌体呈圆形，直径约1 mm，表面光滑，半透明；严格厌氧生长。基于16S rRNA基因序列分析结果可知：G0441菌株属于γ变形菌纲，Orbaceae科，其最近的近缘种均为Gilliamella属物种。G0441基因组大小为2.6 Mb，总GC含量比值为35%；基因组编码2 350个基因，其中包括2 299个蛋白编码基因，蛋白编码基因序列长度占比为85%。对蛋白编码基因进行COG功能分类注释，结果显示：氨基酸转运和代谢、碳水化合物转运和代谢、翻译-核糖体结构与生物发生、转录、复制-重组-修复、细胞壁/细胞膜/包膜生物发生等功能类别得到显著富集。此外，从G0441基因组中还注释得到159个毒力因子、77个耐药基因、22个碳水化合物活性酶、255种转运蛋白、565个跨膜蛋白基因、201个信号肽蛋白基因及多个脂蛋白基因。泛基因组分析显示：在6种近缘菌株的同源基因中，存在145个共有基因（Core gene）和7 190个特有基因（Specific gene），其中，G0441含有221个特有基因。基于core单拷贝基因和全基因组SNP位点的系统进化树分析均表明：G0441与Gilliamella sp. ESL0441菌株亲缘关系最为接近。本研究分离并鉴定了一种中华蜜蜂肠道菌Gilliamella菌株（命名为Gilliamella sp. G0441）。本研究获得的菌株基因组信息为进一步探索Gilliamella sp. G0441相关功能奠定基础。

关键词：中华蜜蜂,肠道菌群,Gilliamella,基因组分析,

基金资助：广州市科技计划项目（202103000009）；广东省科学院科技发展专项（2022GDASZH-2022010106，2022GDASZH-2022010102）；南岭国家公园生态系统与生物多样性监测（一期）（LC-2021124）；广东省乡村振兴战略专项资金种业振兴项目（2022-440000-4301030211-9465，2024-XPY-00-014）；广东省创新人才培养专项资金“海外名师”项目；广东省科学院动物研究所高级科研人员引进计划专项（GIABR-gjrc201702）