狗枣猕猴桃AkMYB5基因的生物信息学分析

来源：湖北农业科学杂志2020年第11期北京时间：

作者：刘丹, 李然红, 陈鑫, 王立凤

单位：牡丹江师范学院生命科学与技术学院, 黑龙江 牡丹江 157012

摘要：为研究狗枣猕猴桃[Actinidia kolomikta （Maxim. et Rupr.） Maxim.]AkMYB5的功能, 利用生物信息学工具和方法, 对其编码蛋白质的理化性质、亲水/疏水性、跨膜结构、结构功能域、二级结构、三级结构、蛋白质修饰位点及同源性等进行分析和预测。结果表明, AkMYB5的cDNA全长为1 339 bp, CDS为1 053 bp, 编码蛋白由351个氨基酸构成的亲水性非稳定蛋白, 属于MYB5蛋白家族（PLN03212）, 主要构件为α-螺旋和不规则卷曲, 与其他18种植物的MYB氨基酸序列进行比对发现, 其与中华猕猴桃变种（Actinidia chinensis var. chinensis）AkMYB5的亲缘关系较近。

关键词：狗枣猕猴桃[Actinidiakolomikta（Maxim.etRupr.）Maxim.],AkMYB5,生物信息学

基金资助：黑龙江省教育厅项目（1354MSYYB006; 1354MSYYB007）; 黑龙江省教育厅备案项目（1351MSYYB007）; 北方药食技术工程中心专项（PT2018011）