滇重楼辣椒轻斑驳病毒分离物的鉴定及全基因组序列分析

来源：湖北农业科学杂志2020年第13期北京时间：

作者：杨林毅a, 陈潞a, 陈泽历b, 飞进强b, 王喆a, 徐绍忠b, 赵明富a, 文国松b

单位：云南农业大学,a.农业生物多样性与病害控制教育部重点实验室; b.农业与生物技术学院,昆明 650201

摘要：滇重楼（Paris polyphylla var. yunnanensis）是多年生草本植物,其药用部位为地下根茎,是一种重要的中药材。为明确侵染滇重楼的病毒病原,对采自云南省曲靖市的滇重楼进行透射电镜观察、DAS-ELISA和RT-PCR技术检测。在透射电镜下观察到杆状病毒粒子,大小为（200~300） nm×（20~36） nm。对采集到的7份病样进行DAS-ELISA检测,结果表明,其中5份病样呈阳性。通过RT-PCR技术扩增、克隆获得1个全长为6 357 bp的曲靖分离物PMMoV-QJ的全基因组序列。将PMMoV-QJ的全基因组序列与国内外已经报道的10个PMMoV分离物进行同源性分析比对,其同源性为99.42%~99.81%。基于全基因序列的系统发育分析表明,PMMoV-QJ与韩国分离物亲缘关系密切。本研究明确了该分离物的亲缘关系,从分子水平鉴定该分离物,为后续滇重楼病毒病的预防提供理论依据。

关键词：滇重楼（Parispolyphyllavar.yunnanensis）,辣椒轻斑驳病毒（PMMoV）,鉴定,序列分析

基金资助：国家自然科学基金项目（81860774）