野桑蚕Hippo通路核心基因的鉴定与序列比较分析

来源：湖北农业科学杂志2020年第13期北京时间：

作者：孟刚, 彭云武, 王瑞娴, 楚渠, 梁嘉俊, 凌君

单位：安康学院陕西省蚕桑重点实验室,陕西 安康 725000

摘要：Hippo信号通路在动物生长发育过程中起到关键作用。根据已知的Hippo通路组成基因序列,利用BLAST软件同源鉴定野桑蚕（Bombyx mandarina）转录组中的Hippo通路组成基因序列,利用生物信息学工具（ORFinder、web CD-search tool、Expasy-protparam、EMBL-EBI、MEME）分析蛋白质相对分子质量、等电点、二级结构、保守结构域和保守基序等。利用Clustalx和MEGA 6.0进行同源序列比对并构建系统进化树。在野桑蚕中鉴定了salvador、warts、mats、yorkie和scalloped同源基因,并预测了ORF框和编码蛋白。结果表明,野桑蚕Warts、Sav和Mats与家蚕同源蛋白的一致性均在98%以上,Yki和Scalloped与家蚕一致性分别为89.02%和79.13%。比较两者差异,家蚕Yki、Sd蛋白分别缺失了近WW2结构域和在YAP结合结构域中存在蛋白片段插入,野桑蚕Sd蛋白缺失了核定位信号基序和脯氨酸富集基序之间的铰链区。Yki和Sd可按照物种科属分别聚类,野桑蚕与家蚕聚为一支,表明这些同源蛋白在功能相似的同时,也具有基于物种的功能特异性。本研究为深入研究野桑蚕Hippo通路的作用机制提供理论基础。

关键词：野桑蚕（Bombyxmandarina）,Hippo通路,聚类分析

基金资助：陕西省教育厅重点实验室科研计划项目（18JS001; 18JS003）; 安康学院高层次人才科研专项（2016AYQDZR02）; 安康学院硕士点培育学科建设专项（2016AYXNZX018）