PAM细胞中猪MMP14不同转录本检测及其生物信息学分析

来源：湖北农业科学杂志2020年第23期北京时间：

作者：吴俊静1, 万绪玲2, 黄藏宇1, 乔木1, 武华玉1, 梅书棋1, 彭先文1

单位：1.湖北省农业科学院畜牧兽医研究所/动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室,武汉 430064; 2.江夏区动物卫生监督所,武汉 430200

摘要：基质金属蛋白酶14(MMP14)是基质金属蛋白酶家族中首个被发现的膜型基质金属蛋白酶。MMP14蛋白能水解多种细胞外基质组分和血清蛋白,促进细胞外基质降解,并可水解细胞因子、趋化因子和生长因子等。研究发现猪肺泡巨噬细胞(PAM)中存在2种猪MMP14转录本,利用荧光定量PCR技术检测了PRRSV感染的猪PAM细胞中猪MMP14基因不同转录本的表达水平变化,发现PRRSV感染后导致转录本NM_214239.2显著下调表达(P<0.05),而转录本XM_021098303.1极显著上调表达(P<0.01)。通过生物信息学分析发现,2种转录本编码的蛋白前肽区序列存在明显差异。XM_021098303.1编码的蛋白比NM_214239.2编码的蛋白序缺少了RRKR基序和PG_binding_1功能区,可能导致MMP14蛋白不具有功能活性。推测PRRSV感染后抑制MMP14活性,与PRRSV刺激细胞因子与趋化因子的大量表达相关。然而,MMP14在PRRSV感染中的具体作用还有待进一步研究。

关键词：猪,MMP14,不同转录本,PRRSV

基金资助：湖北省重大科技创新项目(2019ABA084);湖北省创新群体项目(2018CFA014);湖北省农业科技创新中心创新团队项目(2019-620-000-001-18);湖北省创新体系项目(2018skjcx05)