白菜CRM基因家族的生物信息学分析

来源：湖北农业科学杂志2021年第9期北京时间：

作者：朱斌1, 王晓双1, 罗茜1, 胡鑫2

单位：1.贵州师范大学生命科学学院,贵阳 550025;2.浙江农林大学,杭州 311300

摘要：CRM（Chloroplast RNA splicing and ribosome maturation）蛋白结构域参与调控植物线粒体和叶绿体内包含Ⅱ型内含子基因的剪接。研究利用生物信息学的方法,对白菜（Brassica rapa,AA,2n=20）CRM基因家族的基因数量、保守基序、进化关系、氨基酸等电点以及表达量差异等进行分析。结果表明,白菜CRM基因家族共包含22个基因,可分为3个亚族,分布于白菜除A10外的9条染色体上。CRM蛋白编码基因的长度在657~5 909 bp,蛋白质等电点为4.42~9.89,大多数的蛋白质偏碱性。在表达模式上,不同组织和不同胁迫下白菜CRM基因的表达量存在较大差异,部分CRM基因在叶和茎中的转录表达较活跃;以Flg22和Ps模拟生物胁迫,部分CRM基因的表达量显著下调,CRM基因可能响应植物的生物胁迫。

关键词：白菜,CRM基因家族,生物信息,生物胁迫

基金资助：国家自然科学基金项目（31801391）