从江田鱼肠道微生物多样性分析

来源：湖北农业科学杂志2022年第5期北京时间：

作者：李小义, 申晓东, 张效平, 杨星, 关梅, 王雪

单位：贵州省农业科学院水产研究所/贵州省特种水产工程技术中心,贵阳 550025

摘要：对不同养殖时间点（1 d、2个月、5个月）的从江田鱼肠道细菌进行了测序分析。结果表明,RS1（1 d）和RS3（5个月）组样品肠道细菌多样性高于RS2（2个月）组。门水平分析,RS1组样品中厚壁菌门（Firmicutes,33.43%）、蓝细菌（Cyanobacteria,28.15%）、变形菌门（Proteobacteria,22.94%）和拟杆菌门（Bacteroidetes,9.79%）为主要优势菌;RS2组样品中的优势菌门为变形菌门,所占丰度为94.05%,其次为厚壁菌门（2.58%）、梭杆菌门（Fusobacteria,2.05%）和放线菌门（Actinobacteria,0.68%）。RS3组样品中优势菌门为蓝细菌（40.69%）、变形菌门（31.65%）、梭杆菌门（10.30%）和厚壁菌门（8.89%）。属水平分析, RS1组微生物多样性较高,未分类的蓝细菌（unidentified Cyanobacteria,28.11%）丰度最高,其次为Romboutsia（13.33%）、未分类的梭菌属（unidentified Clostridiales,8.37%）、鞘氨醇单胞菌（Sphingomonas,4.62%）等菌属。RS2组样品中,气单胞菌属（Aeromonas）相对丰度最高,为68.86%。RS3组样品中,未分类的蓝细菌相对丰度最高,为40.63%;其次是气单胞菌属（12.41%）、鲸杆菌属（Cetobacterium,10.20%）等菌属。研究结果表明,稻田养殖系统中从江田鱼的肠道细菌群落在不同生长阶段变化明显。

关键词：肠道细菌,从江田鱼,多样性,高通量测序

基金资助：贵州省科技计划项目（黔科合支撑[2017]2537）; 国家自然科学基金地区基金项目（31660746）; 贵州省特色水产产业技术体系（GZCYTX2019-01102）; 国家特色淡水鱼产业技术体系贵阳综合试验站（CARS-46）