小胸鳖甲Attacin基因结构与功能生物信息学分析

来源：湖北农业科学杂志2022年第24期北京时间：

作者：李洁琼, 李小万

单位：新疆农业职业技术学院,新疆 昌吉 831100

摘要：为了解小胸鳖甲抗菌肽基因 MpAtt1和MpAtt2的结构与功能,借助生物信息学相关软件,对2个基因所编码的氨基酸理化性质、信号肽、跨膜结构、蛋白质的二级结构,蛋白质翻译后修饰、功能结构域、蛋白质的三级结构及亚细胞定位、Attacin同源性进行生物信息学分析。MpAtt1和MpAtt2二级结构以无规则卷曲和β-折叠为主,存在大量的潜在磷酸化位点,三级结构具有高度保守性,具有Attacin_C结构域和Gloverin结构域,属于Attacin_C超家族。MpAtt1和MpAtt2蛋白为可溶性分泌蛋白,含有N-端信号肽。与鞘翅目光滑鳖甲抗菌肽Attacin1序列在氨基酸水平上具有84.77%的一致性。这表明MpAtt1和MpAtt2具有较好的抗菌活性,为该基因的功能鉴定提供理论基础,以期为研究昆虫小胸鳖甲的耐寒机制提供基因来源。

关键词：小胸鳖甲,抗菌肽,Attacin,结构,生物信息学分析

基金资助：新疆维吾尔自治区自然科学基金资助项目（2020D01A69）