基于加权基因共表达网络分析探究桑树光合相关基因的调控模式

来源：湖北农业科学杂志2022年第24期北京时间：

作者：李勇, 黄锦, 于翠, 莫荣利, 朱志贤, 董朝霞, 胡兴明, 邓文

单位：湖北省农业科学院经济作物研究所,武汉 430064

摘要：基于前期桑树转录组数据和光合表型数据,通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）共获得10个基因模块与表型关联,筛选到MEmagenta、MEgreen、MEyellow、MEpurple和MEblack光合相关基因模块。GO和KEGG分析显示,DEGs显著富集在光合相关酶活性、碳代谢和固碳等途径,筛选到12个与光合作用高度相关的基因。通过RNA-seq结合WGCNA分析,筛选了3个光合关键基因,即光系统Q（B）蛋白L484_000029基因、核糖二磷酸羧化酶L484_000836基因、核糖二磷酸羧化酶/加氧酶激活酶2 L484_025354基因。该结果为进一步研究桑树光合作用调控机理提供支持。

关键词：加权基因共表达网络分析,桑树,光合相关基因

基金资助：湖北省重点研发计划项目（2022BBA0065）; 国家现代农业产业技术体系建设专项项目（CARS-18）