不同群体日本沼虾的线粒体COI基因序列分析

来源：湖北农业科学杂志2023年第5期北京时间：

作者：黄辉, 刘凯, 王宇希, 郭炜, 马恒甲, 谢楠

单位：杭州市农业科学研究院,杭州 310024

摘要：采集钱塘江（QT）、武义（WY）、高塘湖（GT）、肇庆（ZQ）和南宁（NN）5个不同群体的日本沼虾（Macrobrachium nipponense）样本,并对每个群体的线粒体COI基因进行测序和分析,以此了解各群体间的遗传差异。结果表明,日本沼虾COI基因序列中,保守位点420个,变异位点222个,简约信息位点123个,碱基缺失或插入位点27个,平均转换与颠换比值2.78。COI基因序列中（A+T）的含量明显高于（G+C）的含量,碱基组成具有明显的AT偏倚性。在67个个体中定义了65种单倍型,来自NN群体和QT群体的单倍型形成了2个主要分支。基于遗传距离构建的系统发育树和聚类树表明,QT群体和GT群体遗传距离较近,与ZQ群体和NN群体相比遗传距离较远,WY群体与QT、GT群体的遗传距离较小。研究结果可为日本沼虾种质资源的合理开发利用提供分子生物学依据。

关键词：日本沼虾（Macrobrachiumnipponense）,线粒体,遗传差异

基金资助：杭州市农业科学研究院创新与推广基金项目（2021HNCT-16）