《湖北农业科学杂志》发表论文赏析
作者:杨玉霞1, 李静婷1, 李颖1, 苏晨2,3, 闫睿1, 魏泽昶1
单位:1.兰州交通大学生物与制药工程学院,兰州 730070; 2.平顶山学院河南省生态经济型木本植物种质创新与利用重点实验室,河南 平顶山 467000; 3.首都师范大学资源环境与旅游学院,北京 100048
摘要:为明确八角枫(Alangium chinense (Lour.) Harms)叶绿体基因组的结构特点及系统发育关系,通过Illumina高通量测序技术对八角枫叶绿体基因组进行测序,并进行组装、注释和结构分析。利用mVISTA和Geneious软件对八角枫、毛八角枫、高山八角枫、八角枫MG524996和八角枫NC044840叶绿体基因组进行同源比对和共线性分析,采用MEGA 11软件构建植物系统发育树。结果表明,八角枫完整的叶绿体基因组全长156 672 bp,呈双链环状结构,GC占37.69%;叶绿体基因组共有130个编码基因,包括81个蛋白质编码基因(PCGs)、38个tRNA转运基因、8个rRNA基因和3个假基因,其在叶绿体基因组序列中占比分别为62.31%、29.23%、6.15%和2.31%。同源比对和共线性分析发现,5种植物(八角枫、其他4种八角枫属植物)叶绿体基因组间具有高度相似性和共线性。系统发育分析表明,八角枫与高山八角枫亲缘关系最为接近,暗示他们在进化上具有共线性,推测该八角枫为新亚种。
关键词:叶绿体基因组,八角枫属,近缘属植物,系统发育
基金资助:国家自然科学基金项目(32360484); 河南省高等学校重点科研项目(22B210008); 大学生创新创业训练计划项目(CXXL20230184)