《湖北农业科学杂志》发表论文赏析

铁皮石斛根发育的转录模式及转录因子相关基因的差异表达

来源:湖北农业科学杂志2025年第2期北京时间:

作者:陈宏宇1a,2, 于莹1b, 任得强1a, 阮志珍1a, 李二妹1a, 冉琳琳1a

单位:1.贵州中医药大学,a.药学院;b.基础医学院,贵阳 550025;2.贵州省中药生药学重点实验室,贵阳 550025

摘要:采用Illumina HiSeqTM4000测序平台对铁皮石斛(Dendrobium officinale Kimura et Migo)根2个不同部位(根尖区和根成熟区)样品进行测序,对差异表达基因进行GO聚类和KEGG分析。结果表明,铁皮石斛根的高质量读长被组装成136 541个单基因,平均长度为982 bp。对具有编码转录因子能力的基因进行鉴定和分类统计,20 105个单基因被映射到55类转录因子中,共识别了148个MADS-box、737个NAC、449个WRKY、369个MYB和105个ARF等。差异表达基因的调控通路涉及很多途径,包括苯丙烷生物合成等次生代谢途径、植物病原体相互作用等环境应答途径以及植物MAPK信号通路等信号转导通路途径。

关键词:铁皮石斛(DendrobiumofficinaleKimuraetMigo),根,发育,基因,转录模式,转录因子,差异表达

基金资助:贵州省中医药管理局中医药、民族医药科学技术课题研究资助项目(QZYY-2024-115); 贵州省科技厅基础研究计划项目(黔科合基础-ZK[2022]一般481); 贵州中医药大学博士启动基金项目(贵中医博士启动[2019]076号)

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