大叶黄精和黄精中与有机酸代谢相关的bHLH转录因子家族分析

来源：湖北农业科学杂志2025年第2期北京时间：

作者：朱天润, 万小林, 粱思琪, 肖强

单位：湖北民族大学林学园艺学院/生物资源保护与利用湖北省重点实验室,湖北 恩施 445000

摘要：采用测序平台对大叶黄精（Polygonatum kingianum var. grandifolium）和黄精（Polygonatum sibiricum Red）转录组进行测序,利用生物信息学方法对与有机酸代谢相关的bHLH转录因子家族进行鉴定,对预测的蛋白质开展理化性质、结构域以及系统进化关系的分析。结果表明,基于大叶黄精和黄精的转录组数据,共获得转录因子46 682个,其中bHLH转录因子110个;总转录数据中具有显著差异的转录因子共978个,其中bHLH转录因子共53个;结合代谢组预测数据,得到与有机酸相关的转录因子31个,其中与有机酸相关的bHLH转录因子22个。除Cluster-43865.11外,Motif 1在其他序列中均有分布,绝大多数序列均含Motif 4;22个bHLH转录因子家族成员均存在不同程度的保守基序变异现象,每个bHLH含有1~14个Motif,平均含有7.81个Motif。

关键词：大叶黄精（Polygonatumkingianumvar.grandifolium）,黄精（PolygonatumsibiricumRed）,有机酸,bHLH转录因子,生物信息学,家族,鉴定

基金资助：国家自然科学基金项目（31260057）; 湖北省科技厅技术创新重大专项（2019ACA120）