郧西马头山羊线粒体DNA D-loop区遗传多样性分析

来源：湖北农业科学杂志2025年第7期北京时间：

作者：程蕾1, 刘辰晖1, 陈杨1, 向敏1, 余婕1, 钟朱夏1, 夏永春2, 杨务军3, 胡修忠1

单位：1.武汉市农业科学院畜牧兽医研究所,武汉 430065; 2.郧西青青马头羊养殖专业合作社,湖北 十堰 442624; 3.郧西县畜牧兽医服务中心,湖北 十堰 442624

摘要：基于线粒体DNA（mtDNA）D-loop区序列的遗传变异分析,评估郧西马头山羊（Capra hircus）的遗传多样性。通过PCR扩增和测序获得184只郧西马头山羊mtDNA D-loop区全序列,系统分析其核苷酸多态性和单倍型多样性,开展中性检验（Tajima’s D、Fu’s Fs）和错配分布分析,并与不同山羊品种的mtDNA D-loop序列进行聚类分析。结果表明,郧西马头山羊mtDNA D-loop的A、G、C、T 4种碱基占比分别为30.77%、14.26%、26.26%、28.71%,A+T碱基的占比为59.48%,明显高于G+C（40.52%）。郧西马头山羊mtDNA D-loop共有52种单倍型,131个变异位点,其中单一多态位点51个,简约信息位点80个。Fu’s Fs检验结果显示,Fs为-2.48,显著偏离中性模型（P < 0.05）。郧西马头山羊与其他5个山羊品种（川东白山羊、陕南白山羊、黄淮山羊、北川白山羊、波尔山羊）的系统发育树显示,184个个体被分为3个大分支,分别为2个本地支与1个波尔山羊杂交支。郧西马头山羊群体的多态程度高,遗传多样性丰富,具有较大的育种潜能,但存在周边多个地方山羊品种和波尔山羊的遗传渗入现象。

关键词：郧西马头山羊（Caprahircus),线粒体DNA,D-loop区,遗传多样性

基金资助：武汉市农业科学院郧西县技术合作项目; 湖北省重点研发计划项目（2021BBA247）