金耳T-1的生物学特性及全基因组测序分析

来源：湖北农业科学杂志2025年第8期北京时间：

作者：田爽, 毕宇, 郭燕, 吴皓琼, 叶阳, 刘佳宁, 朱加楠

单位：黑龙江省科学院微生物研究所,哈尔滨 150010

摘要：以金耳(Naematelia aurantialba)T-1孢子为试验材料,对金耳的生物学特性进行探究并对其进行全基因组测序及分析。结果表明,T-1的最佳碳源为蔗糖,最佳氮源为蛋白胨,最佳无机盐为氯化钾,最适宜pH为7,最佳接种量为108个细胞/mL;基因组碱基测序质量为35~40,测序质量较好;碱基的AT、GC含量较为均一,测序结果正常;利用K-mer频率分析出T-1基因组大小为26 612 159 bp;对测序数据拼接后显示N50较高,GC含量为56.45%;使用Circos软件对基因组进行展示表明,T-1基因组全长为18 180 385 bp,GC含量为56.46%,基因组共被分为10个contig;系统发育树显示T-1与金耳菌株聚类关系最近;GO功能分类显示被注释到3大类别中,其中参与生物学过程的基因最多;与KEGG数据库比对后,共4 096个基因被注释到五大类代谢途径,其中参与代谢途径的基因最多。

关键词：金耳(Naemateliaaurantialba),生物学特性,全基因组测序,功能预测,通路富集分析

基金资助：黑龙江省属科研院所科研业务费项目(2023SSKY004-04)