《湖北农业科学杂志》发表论文赏析
作者:邓克林1,3, 卢自华1,3, 李艳娇1, 杨远霄1, 黎超1, 陈水莲1, 杨红丽1, 单志慧1,2, 郝青南1,2, 陈海峰1,2
单位:1.中国农业科学院油料作物研究所,武汉 430062; 2.农业农村部油料作物生物学与遗传改良重点实验室,武汉 430062; 3.中国农业科学院研究生院,北京 100081
摘要:从武汉采集表现花叶症状的大豆叶片,通过RT-PCR检测和全基因组扩增,获得一株大豆花叶病毒(SMV),命名为SMV-WH。SMV-WH的基因组全长为9 940 nt,其编码多聚蛋白的开放阅读框位于111~9 719 nt。序列分析表明,SMV-WH与GenBank中164个SMV的全基因组核苷酸序列一致性在74.88%~98.36%,氨基酸序列一致性为75.15%~99.09%,表明SMV-WH具有较高的遗传多样性。系统进化分析显示,SMV-WH与来自中国的分离株LJZ010、LJZ002、DSMZ PV-0841、DSMZ PV-0938、JSJJ00和SCSN及来自韩国的分离株Anseong聚为一簇,与Anseong和SCSN亲缘关系最近。蛋白1(P1)中E299K的突变改变了蛋白激酶C磷酸化位点,而辅助组分蛋白酶(HC-Pro)中G593S的突变改变了酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点。三维结构预测表明这些突变引起了蛋白构象的变化。
关键词:大豆花叶病毒,武汉分离物,全基因测序,系统进化
基金资助:国家重点研发计划项目(2022YFF1001504); 国家重大科技项目(2023ZD04037)