天祝白牦牛KAP1.1基因亚型B2A克隆及鉴定

来源：华北农学报杂志2015年第1期北京时间：

作者：张良斌, 梁春年, 裴杰, 褚敏, 吴晓云, 张建一, 潘和平, 阎萍

单位：1. 西北民族大学 生命科学与工程学院, 甘肃 兰州 730030;；2. 中国农业科学院 兰州畜牧与兽药研究所, 甘肃 兰州 730050;；3. 甘肃省牦牛繁育工程重点实验室, 甘肃 兰州 730050

摘要：通过对天祝白牦牛高硫角蛋白基因启动子 B2A 克隆得到其序列,将序列提交到NCBI,登录号:KJ910005,并对其进行生物信息学分析,通过亚细胞定位,磷酸化分析,二级、三级结构和保守结构域预测结果比较,MEGA 5.10 软件进行NJ法进化树构建和MegAlign进行蛋白质相似分析来分析 B2A 基因与 KAP1.1 (Keratin associated protein1.1) 基因的差异性。B2A 基因的CDS区全长为471 bp,共编码156个氨基酸,二级结构含有延伸链、β转角和无规卷曲3种。B2A蛋白和KAP1.1蛋白的亚细胞定位,磷酸化分析,保守结构域,二级结构、三级结构和同源性差异较大。但是从功能预测结果显示2个蛋白功能完全一致,并且使用Clustal X进行氨基酸序列比对分析显示B2A蛋白从第33位开始相对于KA1.1蛋白有10个氨基酸的缺失以外,其余序列之间的保守性相当高。因此,可以证明 B2A 基因是 KAP1.1 基因的基因亚型。

关键词：牦牛,<em>B2A</em> 基因,KAP1.1蛋白,基因亚型,

基金资助：科技支撑计划项目(2012BAD13B05);行业科研项目 (201003061z);甘肃省农业生物技术研究与应用开发项目(CNSW-2011-23);西北民族大学2014年度研究生科研创新项目(ycx14162)