八眉猪DQA基因编码区多态性及生物信息学分析

来源：华北农学报杂志2015年第1期北京时间：

作者：刘丽霞, 张丽, 赵生国, 滚双宝

单位：1. 西北民族大学 生命科学与工程学院, 甘肃 兰州 730030;；2. 甘肃农业大学 动物科学技术学院, 甘肃 兰州 730070;；3. 甘肃省现代养猪工程技术研究中心, 甘肃 兰州 730070

摘要：采用克隆测序的方法对八眉猪 DQA 基因编码区进行多态性分析,并利用生物信息学方法预测八眉猪 DQA 基因的理化特性及其编码产物的结构功能。结果显示:八眉猪 DQA 基因编码255 个氨基酸,编码区序列有14 个碱基变异,11 个氨基酸变异,外显子2区域表现出丰富的多态性。DQA 基因编码产物是一种不稳定的水溶性蛋白,二级结构为混合型,三级结构由α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规则卷曲组成。 蛋白质功能预测结果显示,信号转导、受体、胁迫应答、免疫应答和生长因子的几率较高。研究结果为八眉猪的抗病分子育种和经济性状相关基因筛选提供理论依据。

关键词：八眉猪,<em>DQA</em> 基因,编码区,多态性,生物信息学,

基金资助：西北民族大学中央高校基本科研业务费专项资金(31920130048);甘肃省农牧厅生物技术专项(GNSW-2008-04)