猪嵴病毒CH441株VP1基因的克隆与序列分析

来源：华北农学报杂志2015年第2期北京时间：

作者：祝俊鹏, 杨彬, 兰喜, 柳纪省, 马小军

单位：1. 甘肃农业大学 动物医学院, 甘肃 兰州 730070;；2. 中国农业科学院 兰州兽医研究所, 家畜疫病病原生物学 国家重点实验室, 草食动物疫病重点开放实验室, 甘肃 兰州 730046

摘要：为了深入研究嵴病毒(swKoV)主要结构蛋白基因 VP1,根据GenBank中已发表的猪嵴病基因序列设计特异性引物,采用RT-PCR方法扩增猪嵴病毒CH441株 VP1 基因,并对其进行克隆与测序分析。结果表明,swKoV CH441株的 VP1 基因为762 bp,与GenBank已发表的嵴病毒属的15株嵴病毒序列的 VP1 基因相比较,swKoV CH441株的 VP1 基因与其他各毒株 VP1 基因的核苷酸同源性为81.5% ~90.2%,氨基酸同源性为86.6% ~96.9%,进化分析显示,swKoV CH441株与GS-1株之间的亲缘关系较近。生物信息学分析显示,VP1蛋白理论等电点(pI)为4.40,理论分子质量为26.978 2 kDa;其序列上共发现18个磷酸化位点,分别为Ser (7)、Thr(6)和Tyr(5),而蛋白的磷酸化与信号转导有关,预测该蛋白为一重要的信号转导分子;无信号肽和跨膜区。为进一步开展swKoV CH441株 VP1 基因在遗传变异等方面的研究奠定了理论基础。

关键词：<em>VP1</em> 基因,克隆,DNA测序,序列分析,

基金资助：国家国际科技合作专项(2011DFA31830)