细粒棘球蚴TSP1和TSP6基因的克隆及生物信息学分析

来源：华北农学报杂志2015年第2期北京时间：

作者：刘田莉, 孟庆玲, 乔军, 陈诚, 马玉, 胡政香, 才学鹏, 陈创夫

单位：1. 石河子大学 动物科技学院, 新疆 石河子 832003;；2. 中国农业科学院 兰州兽医研究所, 甘肃 兰州 730046

摘要：为了研究绵羊细粒棘球蚴重要抗原基因Tetraspanin 1-TSP1(TSP1)和Tetraspanin 1-TSP6(TSP6)的功能,对GenBank中Eg基因组数据库检索,获得 TSP1和TSP6 的cDNA序列并设计特异性引物。以Eg头节为总RNA模板,进行RT-PCR,将PCR产物克隆到pMD19-T载体后测序并进行生物信息学分析。 TSP1 cDNA全长792个核苷酸,编码263个氨基酸,该多肽含有3个潜在的N端糖基化位点,2个N端酰基化位点,与已登录的标准株 TSP1 基因序列(EG_11043)同源性为98.99%,其推导的氨基酸序列同源性为98.48%; TSP6 cDNA全长666个核苷酸,编码221个氨基酸,该多肽含有5个N端酰基化位点,1个酪氨酸激酶磷酸化位点,与已登录的标准株 TSP6 基因序列(EG_00715)同源性为98.18%,其推导的氨基酸序列同源性为85.07%。运用分子生物学软件对Eg TSP1和TSP6 基因进行生物信息学分析,预测已知序列的蛋白质抗原的结构和表位,为疫苗的研发奠定了前期基础。

关键词：细粒棘球蚴,抗原基因,基因克隆,生物信息学分析,

基金资助：国家公益性(农业)行业专项(201303037);国家国际科技合作项目(2014DFR31310);新疆自治区研究生科研创新项目(No.XJGRI2014059)