溶藻弧菌外膜蛋白OmpU的原核表达、抗原性鉴定与生物信息学分析

来源：华北农学报杂志2015年第6期北京时间：

作者：刘祥

单位：陕西理工学院 生物科学与工程学院, 陕西 汉中 723001

摘要：对溶藻弧菌外膜蛋白OmpU进行分子克隆构建,抗原性生物信息学分析,为疫苗的开发奠定了基础.通过分子克隆获得OmpU蛋白的原核表达菌株,重组表达后利用切胶纯化获得OmpU蛋白,免疫小鼠制备抗血清,Western Blotting检测发现OmpU蛋白具有很好的抗原性.采用在线软件预测OmpU为亲水的分泌型蛋白;存在多个酶切位点.采用TMHMM Server v.2.0程序预测OmpU无跨膜结构并定位于细胞膜外.通过SignalP 4.1软件分析发现OmpU的1~21位氨基酸为信号肽序列.SOPMA服务器预测OmpU的二级结构含无规则卷曲27.94%,α-螺旋为33.24%,β-转角为10.29%,β-片层为28.53%.采用Swiss Model程序预测三维结构显示OmpU具有3个孔道结构.综合利用ABCpred和BepiPred方案,预测OmpU存在8个B细胞表位.运用神经网络法预测OmpU具有3个CTL表位.使用MHC-Ⅱ类分子结合肽在线程序预测OmpU存在1个Th表位.

关键词：溶藻弧菌,OmpU蛋白,细胞表位,蛋白结构,预测,

基金资助：陕西省教育厅科学研究计划项目(2013JK0723);陕西理工学院人才启动项目(SLGQD13-15)