陆地棉EPSPS基因全基因组分析

来源：华北农学报杂志2016年第1期北京时间：

作者：巩元勇, 徐珍珍, 郭书巧, 束红梅, 蒋璐, 倪万潮

单位：江苏省农业科学院, 农业部长江下游棉花和油菜重点实验室, 江苏南京 210014

摘要：当前在NCBI中提交的来源于陆地棉的EPSPS基因有2个,随着陆地棉基因组测序结果的公布,为在陆地棉基因组中全面鉴定EPSPS基因的存在提供了便利条件。从陆地棉异源四倍体标准系TM-1基因组数据库中共搜寻获得4个EPSPS同源基因,这4个基因分别分布在A07、A12、D07和D12亚基因组。从这4个基因的核苷酸序列、氨基酸序列和基因结构的比对,构建进化树的系统发育分析以及基因的转录情况研究来看,定位在A07和D07亚基因组的2个基因属于共线性高度同源基因,定位在A12和D12亚基因组的2个基因也是相同的情况。序列比对结果表明,已经在NCBI中提交的2个EPSPS基因分别是定位在A12和D12亚基因组上的基因,研究结果为定位在A07和D07亚基因组上EPSPS基因的克隆和功能研究提供了基础理论依据。

关键词：陆地棉,陆地棉基因组,<em>EPSPS</em>基因,

基金资助：国家自然科学基金项目(31301682);江苏省农业科技自主创新基金项目(CX(14)5009);国家转基因重大专项(2013ZX08005)