牦牛和普通牛DRB1* Intron 1-exon 2序列变异分析

来源：华北农学报杂志2016年第3期北京时间：

作者：田知利, 陈杰, 胡江, 罗玉柱, 刘秀, 李少斌, 郭淑珍, 牟永娟

单位：1. 甘肃农业大学 动物科学技术学院, 甘肃省草食动物生物技术重点实验室, 甘肃 兰州 730070;；2. 甘南州畜牧科学研究所, 甘肃 合作 747000

摘要：为揭示牦牛抗逆性及抗病育种积累更多的分子遗传学资料,通过检测DRB1基因在牦牛和普通牛群体中的变异,分析该基因检测区域遗传参数。以甘南牦牛、青海牦牛、天祝白牦牛、大通牦牛和普通牛为研究对象。应用PCR-SSCP方法检测BoLA-DRB1基因第1内含子及第2外显子部分序列多态性。DRB1基因第1内含子区检测到4处SNPs及1处插入/缺失突变,第2外显子区检测到17处SNPs,两区域均表现为高度多态;单倍型连锁分析发现21种intron 1-exon 2单倍型组型且存在单倍型连锁不平衡现象,A-A1、A-B1、B-A1和B-B1单倍型在牦牛和普通牛中频率较高;聚类分析表明,牦牛DRB1基因第2外显子区碱基序列与普通牛及山羊的同源性最高,系统进化情况与它们亲缘关系远近一致。牦牛和普通牛BoLA-DRB1基因第1内含子及第2外显子多态性丰富,可作为牦牛和普通牛BoLA-DRB1的遗传标记。

关键词：牦牛,普通牛,<em>DRB1</em>基因,Intron 1,Exon 2,多态性,

基金资助：甘肃省杰出青年科学基金项目(1210RJDA008);甘肃省农业生物技术研究与应用开发项目(GNSW-2013-9)