甘蓝枯萎病抗性基因FOC1序列分析及抗性相关变异位点分析

来源：华北农学报杂志2016年第3期北京时间：

作者：雷蕾, 马建, 吕红豪, 颉建明, 郁继华, 康俊根

单位：1. 甘肃农业大学 园艺学院, 甘肃 兰州 730070;；2. 北京市农林科学院 蔬菜研究中心, 农业部华北地区园艺作物 生物学与种质创制重点实验室, 北京 100097;；3. 中国农业科学院 蔬菜花卉研究所, 北京 100081

摘要：旨在发掘甘蓝抗枯萎病基因FOC1中与抗性相关的特异性单核苷酸多态性(SNP),为进一步开发FOC1特异分子标记提供理论依据。在对11份甘蓝自交系材料枯萎病抗病表型鉴定基础上,通过基因测序,对每份材料中FOC1等位基因及相应的氨基酸序列变异进行分析。结果表明,FOC1等位基因序列之间共存在92处SNP变异和2处Indel变异,其中包含C381A/G等18个在抗、感材料中表现出特异性差异的SNPs。此18个特异的SNP中转换型比率为86.11%、颠换型比率为13.89%,4种碱基变异率以T/C、G/A最高,分别占47.22%和38.89%,而C/G和A/C变异率共占13.89%。本研究也发现抗、感材料中存在4个特异的SNP,可造成3个氨基酸的变化。

关键词：甘蓝,抗枯萎病,特异SNP,序列分析,

基金资助："十二五"国家科技支撑计划项目(2012BAD02B01;2014BAD01B08);北京市科委项目(Z141105002314020)