尼罗罗非鱼干扰素调节因子1的表达与细胞定位

来源：华北农学报杂志2016年第4期北京时间：

作者：王丹, 解文杰, 朱叶飞, 赵金良, 陈晓武

单位：上海海洋大学 水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室, 上海 201306

摘要：为了分析尼罗罗非鱼干扰素调节因子1（IRF1）的表达规律及其功能，克隆了尼罗罗非鱼IRF1基因cDNA全长，与其他脊椎动物IRF1基因进行比对，构建IRF家族系统进化树。然后使用PolyI：C对尼罗罗非鱼进行体内注射诱导抗病毒免疫反应，利用荧光定量PCR技术检测处理组和对照组中尼罗罗非鱼各组织IRF1基因的表达差异。最后构建尼罗罗非鱼IRF1基因真核表达载体，对其进行细胞定位。结果表明，尼罗罗非鱼IRF1有888 bp的开放读码框，编码295个氨基酸的蛋白序列。该蛋白N端高度保守，并含有6个保守的色氨酸，具有DNA结合结构域。对蛋白相似率的计算发现尼罗罗非鱼与斑马鱼IRF1相似度为52.1%。而与大鼠IRF1的相似率最低，为36.2%。IRF家族成员蛋白序列构建的系统进化树显示，IRF家族共分为4个亚群。将pCMV3-FLAG-IRF1真核表达载体转染到Hela细胞中后，对IRF1进行细胞定位发现，尼罗罗非鱼IRF1主要分布在胞质中，胞核中有少量分布。对尼罗罗非鱼使用PolyI：C进行体内注射诱导抗病毒应答反应，利用实时荧光定量PCR检测到各个组织中IRF1在不同时间下的表达水平有显著差异。本研究完成了尼罗罗非鱼IRF1的表达和细胞定位，对各种脊椎动物IRF家族成员进行了系统进化分析，结果有助于深入了解干扰素系统在机体免疫系统中的调控机制。

关键词：干扰素调节因子,尼罗罗非鱼,系统进化,细胞定位,

基金资助：现代农业产业技术体系专项（CARS-49）；水产动物遗传育种中心上海市协同创新中心 （ZF1206）