小麦抗白粉病基因Pm43定位区段内RGA分析

来源：华北农学报杂志2016年第4期北京时间：

作者：刘静, 乔麟轶, 张晓军, 李欣, 詹海仙, 郭慧娟, 张小辉, 冯建宁, 畅志坚

单位：1. 山西大学 研究生院, 山西 太原 030006;；2. 山西省农业科学院 作物科学研究所, 作物遗传与分子改良山西省重点实验室, 山西 太原 030031;；3. 山西农业大学 研究生院, 山西 太谷 030801

摘要：利用普通小麦测序草图可从基因组范围内对小麦单条染色体上的某个区段进行分析。Pm43是作物遗传与分子改良山西省重点实验室在小麦2D染色体长臂上定位的一个抗白粉病基因。利用信息学方法分析Pm43所在物理图谱、遗传图谱和基因组图谱上的位置，可为其精细定位乃至候选基因的确定提供参考。试验采用Pm43两侧标记序列进行比对，将Pm43定位于染色体C-2DL3-0.49区间的79～99 cM内，所在基因组区段为2DL_9835990～2DL_9823315。利用目前已克隆小麦抗病基因的保守基序作为探针，从目标区段内检索出89条包含抗病基因类似物（Resistance gene analogues，RGA）序列的scaffold，其中，36条scaffold被诊断出含有SSR位点，之后针对SSR位点开发分子标记。利用携带有Pm43的普通小麦材料CH5025、感白粉病材料台长29以及CH5025×台长29的F2作图群体的抗感池DNA，对开发的SSR标记进行连锁性检测，共筛选出4个多态性标记，从而将目标区段进一步确定在标记PK_9908430和NBS_9908778之间。最后经聚类分析，筛选出与已克隆Pm基因同源性较高的1个PK序列和1个NBS序列，且在粗山羊草2D染色体和水稻第4染色体中均存在与这2个序列同源的RGA表达序列。

关键词：<em>Pm43</em>,小麦基因组,2D染色体,PK,NBS,

基金资助：国家自然科学基金项目（31171839）；山西省青年基金项目（2015021145）；山西省科技攻关项目（20150311001-5）；山西省国际合作项目（201603D421003）；山西省农科院攻关项目（15YGG01）