陆地棉NF-YB基因家族的全基因组分析

来源：华北农学报杂志2016年第5期北京时间：

作者：刘静, 徐珍珍, 袁娜, 郭月, 张保龙, 杜建厂

单位：1. 江苏省农业科学院 农业生物技术研究所, 江苏省农业生物学重点实验室, 江苏 南京 210014;；2. 江苏省农业科学院 经济作物研究所, 农业部长江下游棉花和油菜重点实验室, 江苏 南京 210014

摘要：为了进一步了解NF-YB基因家族结构的功能，利用生物信息学手段，系统研究了陆地棉标准系TM-1基因组中NF-YB基因家族的数目、亚细胞定位、染色体分布、进化关系、基序以及组织表达情况。结果表明：TM-1基因组中共有41个NF-YB基因家族成员，它们含有相同的CBFD_NFYB_HMF结构域，大部分定位到细胞核内；41个NF-YB基因家族成员分布在19条染色体上，其中有19组成员在A亚组和D亚组中表现为直系同源基因；进化树分为Ⅰ和Ⅱ 2个小组，每个小组成员间具有相似的基序类型和排列顺序；组织表达分析则发现，在这41个NF-YB基因家族成员中，至少有24个成员可以进行表达，且表现出一定的组织特异性。

关键词：<em>NF-YB</em>基因家族,陆地棉,生物信息,

基金资助：江苏省“333”人才工程项目（BRA2013267）；江苏省农业科技自主创新基金项目（CX13（3059））；棉花生物学国家重点实验室开放课题（CB2016B03）