番茄转录因子基因SlYAB2a的克隆、表达及亚细胞定位分析

来源：华北农学报杂志2016年第6期北京时间：

作者：胡廷章, 秦娟, 陈再刚, 黄小云

单位：重庆三峡学院 生命科学与工程学院, 重庆 404100

摘要：为了研究番茄SlYAB2a基因的功能及其在番茄生长发育中的分子机理，以番茄的cDNA为模板，利用RT-PCR技术从番茄中克隆到SlYAB2a基因，该基因编码的蛋白质由192个氨基酸残基组成，蛋白质的分子量为21.35 kDa，等电点是8.79，平均亲水系数是-0.487。SlYAB2a蛋白质的6～165位氨基酸残基形成Pfam：YABBY结构域，在20～47位有1个C2C2锌指结构域，在122～181位有1个螺旋-环-螺旋结构域。二级结构分析表明SlYAB2a蛋白分子中，α-螺旋占19.79%、β-折叠占14.06%、其余66.15%为不规则卷曲。蛋白多序列比对表明SlYAB2a与马铃薯、林烟草、酿酒葡萄、大豆、拟南芥、甘蓝型油菜、花药野生稻、玉米和小麦YABBY2的一致性分别为98%，78%，71%，65%，64%，64%，58%，57%，57%，说明SlYAB2a蛋白与来源于双子叶植物的YABBY2一致性较高，而与来源于单子叶植物的一致性较低。通过聚类分析发现YABBY2蛋白明显分为单子叶和双子叶2个亚类，SlYAB2a蛋白属于双子叶亚类，与马铃薯、潘那利番茄、绒毛状烟草、林烟草等的YABBY2蛋白序列亲缘关系较近。实时定量RT-PCR分析结果表明，在番茄植物的不同生长发育时期，根、茎、叶、花、果实中，都有SlYAB2a基因表达；并且在花和青熟果实中，SlYAB2a基因表达水平远远高于其他组织。说明SlYAB2a基因在花和果实的发育过程中起着重要作用。洋葱表皮细胞瞬时表达结果表明SlYAB2a蛋白定位于细胞核中。

关键词：番茄,<em>SlYAB2a,</em>基因克隆,表达分析,亚细胞定位,

基金资助：重庆市教育委员会科学技术研究项目（KJ131101）；重庆市万州区科学技术项目（201403063）；重庆三峡学院科学研究计划项目（15PY03）