基于紫娟茶叶片转录组的SSR引物开发

来源：华北农学报杂志2016年第S1期北京时间：

作者：周萌, 宋维希, 鄢文光, 李晓霞, 陈继伟, 夏丽飞, 梁家斌, 陈林波

单位：1. 云南省农业科学院 茶叶研究所, 云南 勐海 666201;；2. 云南省茶树种质资源创新与配套栽培 技术工程研究中心, 云南 勐海 666201

摘要：以稀有茶树品种紫娟茶为研究对象，进行SSR引物开发的研究，从紫娟茶叶片转录组中筛选重复基元最多的SSR，设计并筛选紫娟茶的SSR引物。通过从已测序的紫娟茶叶片转录组中设计SSR引物共87对，通过对紫娟茶以及随机采摘的3份不同品种茶树提取DNA后进行PCR扩增，1%琼脂糖凝胶电泳分析，在紫外凝胶成像仪中观察拍照，判断是否扩增出目标条带。通过试验筛选出可以扩增出清晰目标条带的引物63对，有效率达72.4%，其中有33对表现出多态性，占有效SSR引物的52.4%。结果表明，从紫娟茶叶片转录组中设计引物是可行的。下一步研究将从这63对引物中开发紫娟茶的特异引物。

关键词：紫娟茶,SSR,引物开发,

基金资助：云南科技厅重大专项（2013BB006）；国家自然科学基金项目（31460216；31560200）；云南省农业科学院专项基金项目（YAAS2014JC012）；云南省人才培养计划项目（2015HB105）