草莓轻型黄边病毒外壳蛋白抗原表位预测

来源：华北农学报杂志2016年第S1期北京时间：

作者：邓子兵, 马建忠, 王永刚, 杨菊梅, 魏艳, 潘博, 李印武

单位：1. 兰州理工大学 生命科学与工程学院, 甘肃 兰州 730050;；2. 甘肃启明星节能科技有限公司, 甘肃 兰州 730913

摘要：抗原表位是抗体识别并结合抗原的部位。抗原表位的预测有助于重组抗原的设计、快速筛选和高活性抗原的快速制备。通过DNAStar、ExPASy、TMHMM Sever2.0和IEDB等软件对草莓轻型黄边病毒的外壳蛋白的二级结构、理化及生物学性质进行了分析。分析结果显示，草莓轻型黄边病毒的外壳蛋白中不存在跨膜区域；平均亲水性为-0.252，属于可溶性蛋白；潜在的抗原表位有5个，平均抗原指数为0.026 5~0.077 3。预测的上述5个抗原表位是否有抗原活性及其活性强弱仍有待于相应的试验论证。

关键词：草莓轻型黄边病毒,外壳蛋白,抗原表位,结构预测,

基金资助：甘肃省科技计划项目（1504WKCA020）；甘肃启明星节能科技有限公司；国家大学生创新创业训练项目（DC2015085）