《华北农学报杂志》发表论文赏析
作者:郭陈刚, 李顺国, 魏志敏, 夏雪岩
单位:1. 德州学院, 山东 德州 253023;;2. 河北省农林科学院 谷子研究所, 河北 石家庄 050035
摘要:为了从转录组水平研究黄伞菌的抗肿瘤等药用价值,需要提取分离得到高纯度、高质量的黄伞菌RNA样品。利用液氮研磨TRIzol一步法提取黄伞菌总RNA,并且对经过和未经液氮研磨的黄伞菌RNA提取产物进行了质量检测和统计对比分析。检测结果显示,经液氮研磨样品RNA浓度远远高于未经研磨样品,OD260/280都约等于2,说明其纯度很高。同时,3个重复样品25S和18S亚基条带荧光强度比值分别为1.8,1.9,1.9,接近于2,证明RNA完整性较好,Agilent 2100的RIN值检测结果分别为9.1,8.7,9.3,均远大于6.8标准,进一步佐证了其完整性。所以,液氮研磨TRIzol一步法是非常适用于黄伞菌总RNA高质量提取的简单且高效的方法。
关键词:RNA分离,黄伞菌,RNA-seq,抗肿瘤,
基金资助:山东省教育厅高等学校科研计划项目(J16LE10)