紫苏脂肪酸硫酯酶基因PfFatA生物信息学及其表达特性分析

来源：华北农学报杂志2017年第2期北京时间：

作者：李璐, 梁倩, 安茜, 周雅莉, 王计平

单位：山西农业大学 农学院, 山西 太谷 030801

摘要：为研究脂肪酸硫酯酶A（FatA）在紫苏脂肪酸合成机制中发挥的作用，对紫苏FatA基因及其编码的蛋白质进行生物信息学分析。结果表明，PfFatA基因cDNA全长1 652 bp，开放阅读框1 119 bp，编码372个氨基酸；紫苏FatA基因编码的蛋白质为亲水性不稳定蛋白，无跨膜区域；含Acyl-ACP_TE保守结构域，属于Hotdog fold超蛋白家族；多序列比对结果发现，序列C端含有保守的三联肽AKL和SKV结构；系统进化树分析表明，紫苏与丹参亲缘关系较近。通过Real-time PCR分析得知，PfFatA在紫苏根、茎、叶、花和种子不同发育时期均有表达，其中，在种子发育初期表达量最高。该研究结果可为进一步阐明PfFatA基因的功能及作用机制奠定基础。

关键词：紫苏,脂肪酸硫酯酶基因(<em>FatA</em>),生物信息学,表达分析,

基金资助：国家自然科学基金项目（31201266）