猪流行性腹泻病毒山西分离株ORF3基因序列分析

来源：华北农学报杂志2017年第4期北京时间：

作者：刘文俊, 王娟萍, 姚敬明, 吴忻, 孟帆, 韩一超, 樊振华, 薛翼鹏, 米瑞娟, 李红丽, 赵岳

单位：山西省农业科学院 畜牧兽医研究所, 山西 太原 030032

摘要：为了研究山西地区猪流行性腹泻病毒ORF3基因的遗传变异情况，2014-2015年从山西地区11个地市收集的PEDV阳性病料中扩增到4株PEDV的ORF3基因，并进行序列比对及遗传分析。序列分析结果表明，4株PEDV山西分离毒株的ORF3基因与CV777毒株相比，无核苷酸插入和缺失，有部分核苷酸及氨基酸发生变异；4株PEDV山西分离毒株的ORF3基因之间核苷酸和氨基酸的同源性分别为99.6%~100.0%和98.7%~99.6%，与CV777、疫苗株CV777 truncated和attenuated DR13核苷酸同源性分别为96.6%~97.0%，90.6%，97.6%~98.1%，氨基酸同源性分别为95.1%~96.0%，88.0%，97.1%~98.1%。遗传进化分析结果显示，4株PEDV山西分离毒株与12株2010-2015年我国各地方分离的毒株和2009年分离的CH/JL/09毒株亲缘关系较近；与CV777、LZC、Brl/87和2个疫苗株（CV777truncated和attenuated DR13）亲缘关系较远。

关键词：猪流行性腹泻,山西分离株,<em>ORF3</em>基因,序列分析,

基金资助：山西省科技攻关项目（20140311020-2-A；20150311018-3）